Offre de stage au Laboratoire de Police Scientifique (LPS) de Paris pour un(e) étudiant(e) de Master 2 en Bioinformatique.

SUJET :
-------
Évaluation d’un progiciel de gestion informatisée de données et intégration de sources de données diverses.

CONTEXTE:
---------
Le LPS de Paris est l’un des 6 laboratoires en France faisant partie intégrante de l'Institut National de Police Scientifique (INPS), établissement public administratif qui regroupe 700 personnes dont 150 biologistes, sous la tutelle du Ministère de l'Intérieur.
Au sein de l’INPS, les LPS examinent et analysent des traces relevées sur les lieux des infractions dans les domaines de la balistique, de l’analyse de documents, de la biologie, des stupéfiants, de la toxicologie, des incendies, des explosions et de la physicochimie.
Le laboratoire de Paris s’inscrit actuellement dans une problématique d’augmentation de l’activité ainsi que dans une démarche d'accréditation selon la norme ISO 17025. Ce contexte a conduit à une réorganisation des méthodes de travail de la division biologie de ce laboratoire, passant notamment par l’évolution des techniques d’analyses et l’automatisation de la division biologie du LPS de Paris. Cette division est équipée de plusieurs plateformes robotisées pour l’automatisation des étapes d’extraction d’ADN, de préparation de la quantification en temps réel, de préparation de l’amplification par PCR et de préparation de l’électrophorèse capillaire.
Dans ce contexte les sources d’informations et les données produites sont en constante augmentation. Malgré la mise en place d’un LIMS, les sources de données (logiciels et applications web) et les espaces de stockage de données (fichiers et bases de données) sont encore trop nombreux et dispersés.

OBJECTIF :
----------
L’objectif est d’évaluer le progiciel de gestion de données Pipeline Pilot (Accelrys).
En complément au LIMS déjà en place, un progiciel de gestion de données basé sur une technologie client-serveur devrais permettre non seulement de regrouper les données dispersées sur 1 ou 2 bases de données, mais aussi de mettre en place des calculs statistiques et tous les traitements de données qui ne rentreraient pas dans le champ d’application du LIMS.

COMPÉTENCES RECHERCHÉES :
-------------------------
Niveau Master 2 en Bioinformatique.
Maîtrise du SGBD MySQL et du langage de programmation Perl.
La connaissance du langage R (calculs statistiques) et du langage Java serait un plus.
Autonomie et esprit de synthèse seront appréciés.

PÉRIODE SOUHAITÉE :
--------------------
Février à août 2010.
La date de début du stage et sa durée sont adaptables en fonction de la disponibilité du stagiaire.

ACCUEIL :
----------
Le stagiaire sera encadré par un ingénieur de Police Scientifique et travaillera en étroite collaboration avec plusieurs techniciens de la cellule informatique au sein de la division biologie du LPS de Paris. Son lieu de stage sera situé dans le 15ème arrondissement de Paris.
Ce stage pourra être indemnisé à hauteur de 390 euros par mois.

CONTACT :
---------
Yann DARSEL
Responsable Recherche et Développement - Biologie
INPS
Laboratoire de Police Scientifique de Paris
3 quai de l’horloge
75001 PARIS
Envoyer CV et lettre de motivation à yann.darsel@interieur.gouv.fr et olivier.foumenaigue@interieur.gouv.fr

yann.darsel@interieur.gouv.fr